不管是在論壇上還是網(wǎng)上，經(jīng)常有人問(wèn)哪里可以下載到破解版的FlowJo或者破解版的× ×。也許商業(yè)軟件的宣傳深入人心。但是我很想說(shuō)，有一個(gè)自由流分析軟件flow，五年前生產(chǎn)的。雖然五年多沒(méi)有更新，但功能絕不遜色于大多數(shù)商業(yè)流量軟件。

這個(gè)軟件是芬蘭的Perttu Terho等人開(kāi)發(fā)的，用流程圖分析，功能齊全，思路清晰。因?yàn)榉治隽鞒毯虵lowJo略有不同，所以必須注意以下步驟。

像其他軟件一樣，更改坐標(biāo)參數(shù)是通過(guò)在坐標(biāo)上單擊鼠標(biāo)右鍵來(lái)選擇的。要設(shè)置門，請(qǐng)?jiān)趫D中的空白色區(qū)域單擊鼠標(biāo)右鍵，然后選擇創(chuàng)建新區(qū)域。至于門的名稱、顏色、邏輯組合和刪除，在右邊的人口窗口中使用鼠標(biāo)右鍵。我覺(jué)得這些功能都比Flowjo好，尤其是邏輯組合:

選中此框，選擇FCS文件，然后右鍵單擊選擇減少事件的方法，可以是固定數(shù)字、百分比、文件頭或交錯(cuò)事件。最后，將此事件數(shù)縮減器與散點(diǎn)圖連接，可以顯示縮減數(shù)的圖形:

3.特點(diǎn):讓直方圖門自動(dòng)微調(diào)

不同的數(shù)據(jù)文件之間，如果兩個(gè)峰值比較明顯，但是它們的分組位置略有變化，人們往往需要手動(dòng)調(diào)整，少數(shù)文件就好說(shuō)了。如果幾百個(gè)數(shù)據(jù)一個(gè)個(gè)調(diào)整，那就累死人了。

流動(dòng)具有自動(dòng)微調(diào)功能。不知道是不是無(wú)知。我覺(jué)得這個(gè)功能很有特色。很少有軟件有這個(gè)功能。

首先畫一個(gè)直方圖，然后在上面畫正負(fù)峰區(qū)域。這一步必須完成:

然后，從菜單創(chuàng)建→區(qū)域控制工具中選擇將區(qū)域移至負(fù)和正總體上:

用鼠標(biāo)右鍵單擊該框，然后選擇活動(dòng)控件:

至于自動(dòng)調(diào)整的算法，有三種算法可以選擇，大部分都是用第一種。如果峰的分離不是特別好或者第一個(gè)被打破，可以選擇后兩個(gè):

然后使用菜單中目錄下的下一個(gè)文件或快捷鍵ctrl+n切換到下一個(gè)文件:

見(jiàn)下圖效果:

4.補(bǔ)償調(diào)整

雖然flow的補(bǔ)償調(diào)整沒(méi)有商業(yè)軟件直觀拖動(dòng)滑塊那么簡(jiǎn)單，但是相對(duì)清晰容易。

選擇創(chuàng)建→數(shù)據(jù)修改工具下的補(bǔ)償數(shù)據(jù)功能:

出現(xiàn)一個(gè)空白色方框，將方框與所選FCS文件的散點(diǎn)圖連接(注意箭頭方向)，然后依次按照下圖中的數(shù)字標(biāo)識(shí):編輯修改→在窗口中選擇調(diào)整補(bǔ)償?shù)膮?shù)，從第二個(gè)參數(shù)中刪除第一個(gè)參數(shù)→點(diǎn)擊保存，調(diào)整溢出值，即可看到散點(diǎn)圖上的圖形補(bǔ)償發(fā)生了變化:

5.直方圖疊加

在創(chuàng)建→可視化工具下選擇疊加直方圖:

然后用這個(gè)方框連接其他直方圖(箭頭指向這個(gè)方框)，可以完成疊加，但是坐標(biāo)要求同名:

這里是FLOWER問(wèn)一下，我想給直方圖加顏色，比較好處理。只需給兩個(gè)普通直方圖添加顏色，疊加的直方圖就會(huì)自動(dòng)顯示透明顏色:

6.批處理和統(tǒng)計(jì)

商業(yè)軟件的批量處理已經(jīng)做了，flow的批量處理一點(diǎn)也不遜色。

比如我想統(tǒng)計(jì)一個(gè)抗原的表達(dá)率。經(jīng)過(guò)一步一步的設(shè)置門，我終于選擇了抗原表達(dá)的直方圖或者散點(diǎn)圖。在鼠標(biāo)右鍵菜單中選擇“創(chuàng)建統(tǒng)計(jì)”，將出現(xiàn)“統(tǒng)計(jì)”框，顯示所有常用參數(shù)。這只是第一步。接下來(lái)，在統(tǒng)計(jì)框上單擊鼠標(biāo)右鍵，并選擇創(chuàng)建統(tǒng)計(jì)列表。接下來(lái)，只需在散點(diǎn)圖或直方圖上按CTRL+N或CTRL+P來(lái)切換前后的數(shù)據(jù)，就會(huì)看到StatList上的數(shù)據(jù)是不斷添加的。最后，您只需要復(fù)制StatList上的數(shù)據(jù)。

更多視頻介紹

這次我們簡(jiǎn)單介紹一下這六個(gè)功能。軟件中有很多功能強(qiáng)大的功能，足夠大家使用。作者發(fā)布的簡(jiǎn)單視頻中，介紹比較多，可以稍微看一下(視頻比較糊，不過(guò)看懂就行):

如果需要更詳細(xì)更高清的視頻教程，可以在官網(wǎng)下載wmv格式的視頻教程:http://flowingsoftware.btk.fi/index.php? Page = 4，但是網(wǎng)速可能會(huì)比較慢。

裝置

這個(gè)軟件需要的支持。net framework 3.5，需要從微軟網(wǎng)站下載:http://www.microsoft.com/zh-cn/download/details.aspx? ID = 21 flow官網(wǎng)下載程序是clickonce發(fā)布的，所以安裝時(shí)默認(rèn)會(huì)安裝到c:temp，容易被誤刪。所以我會(huì)把這個(gè)目錄下的程序解壓重命名，打包上傳到這里。安裝后。net framework 3.5完成后，您可以直接解壓縮并運(yùn)行它們:http://www.flowcyto.cn/bbs/forum.php? mod = view thread & amp；tid = 1664 & amppage=8#pid11275

現(xiàn)在如果非要找商業(yè)軟件，我會(huì)很無(wú)奈

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