連鎖經(jīng)營規(guī)模小，競爭激烈，連鎖經(jīng)營規(guī)模小，內(nèi)部連鎖程度低，沒有統(tǒng)一進貨和發(fā)貨，間接導(dǎo)致各便利店分擔(dān)的銷售成本增加。另外，上門競爭導(dǎo)致單位成本增加，便利店商品價格上漲，顧客流失到超市。

便利店選址不明確，區(qū)位分布不均，集聚現(xiàn)象嚴重。在選址策略上與超市相同或相似。過于注重居住區(qū)，導(dǎo)致便利店網(wǎng)點過多，過于密集，兩者之間的商圈重疊，忽略了辦公區(qū)、學(xué)校、公園，從而使得便利店地理位置的便利性沒有完全顯現(xiàn)出來。在激烈的市場競爭下，客流結(jié)構(gòu)過于單一是不可避免的，影響了便利店的效益。

商品和服務(wù)不體現(xiàn)便利店的特點。目前國內(nèi)大部分非特許便利店在商品選擇上與超市類似，沒有突出便利店“必需品，急用即食”的優(yōu)勢，沒有自主開發(fā)或帶領(lǐng)他人開發(fā)特色商品的能力。商品發(fā)展滯后，完全是超市食品，未能區(qū)分商品。同時，作為優(yōu)于其他零售業(yè)態(tài)的重要特征，多元化的服務(wù)模式基本沒有體現(xiàn)出來。雖然很多便利店掛著“便利店”的牌子，但基本上和連鎖超市差不多，只賣日用品，只是超市概念的延伸，并不是真正意義上的便利店。

信息化程度低，物流系統(tǒng)不完善，零售終端優(yōu)勢難以體現(xiàn)。由于空便利店數(shù)量有限，需要盡量減少門店的庫存。因此，需要有一個能夠滿足多品種、小批量、多頻率及時配送需求的物流配送系統(tǒng)。國外企業(yè)通過構(gòu)建現(xiàn)代先進的物流網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)來降低流通成本。但是，由于資金和現(xiàn)代物流系統(tǒng)的缺乏，中國企業(yè)很難實現(xiàn)大規(guī)模的批量采購，物流中心、配送中心和倉庫建設(shè)的投資也不足，尤其是在軟件應(yīng)用方面。這使得中國零售業(yè)的銷售成本明顯高于國外大型零售商，導(dǎo)致運營成本大幅增加。