在研究基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控的過程中，研究者往往需要構(gòu)建某一基因啟動(dòng)子的熒光素酶報(bào)告質(zhì)?；蝾A(yù)測與某一基因啟動(dòng)子結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子。
有很多網(wǎng)站可以找到啟動(dòng)子序列，比如pubmed，ensemble，UCSC等。，但是這些網(wǎng)站太強(qiáng)大了，裝不下，還很迷茫，浮腫。不用擔(dān)心，這里有一個(gè)超級(jí)友好的網(wǎng)站，可以快速簡單的找到啟動(dòng)子序列，即:
真核啟動(dòng)子數(shù)據(jù)庫
EPD是一個(gè)非冗余的真核POL II啟動(dòng)子子集，其轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)已通過實(shí)驗(yàn)確定。該數(shù)據(jù)庫包含來自幾個(gè)真核物種的啟動(dòng)子信息。具體操作方法如下:
步驟1
打開網(wǎng)站
網(wǎng)址可以通過搜索引擎直接搜索，也可以在“生物大師”后臺(tái)對話框回復(fù)“EPD”。
步驟2
輸入被搜索基因的基因名稱(此處基因名稱指基因符號(hào)，是基因的正式名稱)，選擇物種，點(diǎn)擊搜索
步驟3
點(diǎn)擊你想找的基因
步驟4
進(jìn)入被檢查基因信息的詳細(xì)信息界面
步驟5
在檢索序列下輸入您要查找的啟動(dòng)子序列的起始和終止位置，然后單擊獲取序列。
同時(shí)還可以在搜索模體下拉菜單中找到TATA-box、GC-box、CCAAT-box。
這樣就找到了啟動(dòng)子序列。要知道轉(zhuǎn)錄因子怎么預(yù)測，請聽下分解~ ~
學(xué)霸福利芯片實(shí)驗(yàn)技術(shù)總結(jié)及相關(guān)細(xì)節(jié)。
圖片來源:小草
標(biāo)題圖來源:丁香通行證
1.《啟動(dòng)序列 一招搞定啟動(dòng)子序列查找》援引自互聯(lián)網(wǎng)，旨在傳遞更多網(wǎng)絡(luò)信息知識(shí)，僅代表作者本人觀點(diǎn)，與本網(wǎng)站無關(guān)，侵刪請聯(lián)系頁腳下方聯(lián)系方式。
2.《啟動(dòng)序列 一招搞定啟動(dòng)子序列查找》僅供讀者參考，本網(wǎng)站未對該內(nèi)容進(jìn)行證實(shí)，對其原創(chuàng)性、真實(shí)性、完整性、及時(shí)性不作任何保證。
3.文章轉(zhuǎn)載時(shí)請保留本站內(nèi)容來源地址，http://f99ss.com/yule/1205208.html
