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【澳洲肺魚】澳大利亞肺魚擁有已測序最大動物基因組

資料來源:科學技術日報

科學技術日報北京1月24日電(記者劉霞)英國《新科學家》雜志網(wǎng)站18日發(fā)現(xiàn),奧地利分子病理學研究所的科學家擁有迄今為止測試的所有動物中最大的基因組,其基因組共包含430億對堿基,是人類基因組的14倍以上。

最新研究負責人齊格弗里德·斯克洛斯寧表示,此前最大已測序動物基因組來自墨西哥兩棲動物美西螈。2018年他們對其進行了測序,但澳大利亞肺魚的基因組比其還大30%。

在最新研究中,科學家們使用高性能計算機測序儀將肺魚的基因組拼接起來。為解決測序儀可能造成的錯誤,研究人員使用了基因組的多個拷貝,每個拷貝都被分割成DNA小塊。在對所有片段進行測序后,研究小組使用算法將片段重組成一個完整的基因組。斯克洛斯寧估計,得到結果需要計算機處理大約10萬小時。

斯克洛斯寧說,澳大利亞肺魚原產(chǎn)于昆士蘭州東南部,該動物從水基生活方式過渡到陸基生活方式以來,其外貌幾乎沒有什么變化。

此前,科學家們并不清楚肺魚和腔棘魚(一種發(fā)現(xiàn)于印度洋和印度尼西亞周圍的古老魚類)誰與哺乳動物和鳥類等陸地脊椎動物的關系更密切。新基因組分析明確指出,肺魚與四足動物的祖先關系更密切。腔棘魚較早從這些動物中分化出來;而肺魚在4.2億年前才與這些動物分道揚鑣。

斯克洛斯寧說:“為離開水,肺魚需要適應陸地的生活方式,必須能呼吸空氣,必須能聞到氣味。肺魚背部擁有一個肺,供其呼吸水面上的空氣?!?

在與肺和關節(jié)肢體的發(fā)育以及嗅探氣味有關基因的數(shù)量方面,澳大利亞肺魚與兩棲動物相似。斯克洛斯寧說:“從基因組角度而言,澳大利亞肺魚的基因組介于魚類和陸地脊椎動物之間。”

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