2019年7月23日，蛋白質(zhì)組學(xué)頂級(jí)期刊MOCELL蛋白質(zhì)組學(xué)發(fā)表了中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究所植物生理生態(tài)研究所趙國(guó)平院士和趙薇院士關(guān)于琥珀酰化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)的文章。首次在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)一種特異的琥珀?；窼cCobB2，揭示了其介導(dǎo)的鏈霉菌蛋白合成和碳代謝調(diào)控機(jī)制。

研究速讀學(xué)習(xí)速讀

1.ScCobB2是一種依賴于NAD+的去琥珀?；?/p>

鑒于sirtuins在原核生物中的發(fā)現(xiàn)要少得多，研究人員通過(guò)使用人SIRT5的氨基酸作為查詢序列，鑒定出了兩種與S. coelicor中sirtuin同源的蛋白質(zhì)，即ScCobB1和ScCobB2。隨后的研究表明，ScCobB2具有脫乙酰酶的功能，與ScCobB1不同。

ScCobB2是一種依賴于NAD+的去琥珀?；?/p>

2.甘松蛋白琥珀?；揎椊M學(xué)分析

為了獲得獨(dú)角獸部隊(duì)蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾的細(xì)節(jié)，研究人員采用蛋白質(zhì)組學(xué)方法對(duì)SccobB2突變株和野生型菌株的琥珀?；揎椷M(jìn)行了蛋白質(zhì)組學(xué)分析。GO功能分類顯示，高琥珀?；鞍讌⑴c了多種生物過(guò)程，并具有不同的細(xì)胞定位。KEGG途徑分析表明，琥珀?；鞍自谝缘鞍踪|(zhì)生物合成和碳代謝為特征的各種途徑中顯著富集。

獨(dú)角獸部隊(duì)蛋白質(zhì)琥珀酰化修飾的組織學(xué)分析

3.ScCobB2在蛋白質(zhì)生物合成和細(xì)胞代謝中的調(diào)節(jié)作用

鑒于由獨(dú)角獸細(xì)菌琥珀?；慕M成的數(shù)據(jù)集可能有助于確定琥珀?；嚢彼嶂車囟ò被釟埢钠?，研究人員進(jìn)一步進(jìn)行了基序序列分析。結(jié)果表明，賴氨酸琥珀酰化的優(yōu)先序列在不同的生物體中是保守的，提示相似的動(dòng)力學(xué)或琥珀酰化機(jī)制。同時(shí)，琥珀酰化蛋白相互作用網(wǎng)絡(luò)分析表明，前四簇高度相關(guān)的琥珀?；鞍拙W(wǎng)絡(luò)分別是核糖體相關(guān)蛋白、糖酵解/糖異生、氨酰-tRNA生物合成和氧化磷酸化。最后，研究人員通過(guò)蛋白質(zhì)印跡實(shí)驗(yàn)證實(shí)了ScCobB2在蛋白質(zhì)生物合成和細(xì)胞代謝中的調(diào)節(jié)作用。

ScCobB2在蛋白質(zhì)生物合成和細(xì)胞代謝中的調(diào)節(jié)作用

賴氨酸琥珀酰化的重要性越來(lái)越被人們所認(rèn)識(shí)，在原核生物和真核生物中已鑒定出數(shù)以千計(jì)的琥珀?；鞍?。然而，由于缺乏對(duì)特定去琥珀?；傅拿枋?，很少有琥珀酰化蛋白在細(xì)菌中被定量。在本研究中，首次在細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)了一種特異性的去琥珀?；?，并證明了它在獨(dú)角獸部隊(duì)的生物過(guò)程中起著關(guān)鍵作用。琥珀?；鞍踪|(zhì)組學(xué)分析的數(shù)據(jù)為相關(guān)領(lǐng)域的琥珀?；峁┝舜罅亢蜻x靶標(biāo)，為后續(xù)研究其他微生物的琥珀?；{(diào)控奠定了基礎(chǔ)，再次證實(shí)了蛋白質(zhì)修飾蛋白質(zhì)組學(xué)在科學(xué)研究中的重要意義。

參考文獻(xiàn):

1.張紅等人，2019年，ScCobB2介導(dǎo)的賴氨酸去琥珀?；{(diào)節(jié)天藍(lán)色鏈霉菌中的蛋白質(zhì)生物合成和碳代謝。Mol細(xì)胞蛋白質(zhì)組學(xué)。

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