英國(guó)著名的基因組測(cè)序中心威康信托桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)、法國(guó)巴斯德研究所(Pasteur Institute)的研究人員，以及來(lái)自世界各地的合作者，對(duì)60年來(lái)爆發(fā)于非洲和拉丁美洲的霍亂菌進(jìn)行了研究，破譯了霍亂基因組學(xué)的歷史，對(duì)于完善霍亂控制策略具有積極意義。

霍亂作為一種古老的疾病，給人類帶來(lái)了巨大的災(zāi)難。僅自19世紀(jì)以來(lái)，世界上就發(fā)生了七次霍亂疫情，造成數(shù)百萬(wàn)人死亡。即使在今天，它仍然影響著世界上47個(gè)國(guó)家，每年有近10萬(wàn)人死于這種疾病。

11月10日發(fā)表在《科學(xué)》雜志上的兩項(xiàng)研究結(jié)果結(jié)合了基因組測(cè)序和流行病學(xué)，以評(píng)估不同霍亂菌株引起霍亂流行的風(fēng)險(xiǎn)。

在不同的大陸上有不同種類的霍亂細(xì)菌

在上述研究中，科學(xué)家分析了1200多個(gè)霍亂樣本的基因數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)可以追溯到20世紀(jì)50年代。

研究人員將重點(diǎn)放在非洲和拉丁美洲，因?yàn)檫@些地區(qū)有大量的流行病:第七次霍亂疫情于1970年首次來(lái)到非洲，此后非洲成為受該疾病影響最大的大陸；霍亂1991年后出現(xiàn)在拉丁美洲，100年后出現(xiàn)在美國(guó)。研究人員發(fā)表了兩篇關(guān)于非洲和拉丁美洲霍亂研究的文章，表明大陸之間存在驚人的多樣性；拉美和非洲霍亂毒素品種不同，傳播動(dòng)態(tài)和生態(tài)位也不同。

在非洲

在對(duì)非洲的研究中，研究小組發(fā)現(xiàn)，自20世紀(jì)60年代以來(lái)持續(xù)的大流行是由一種叫做7PET的霍亂弧菌引起的。此后，它被不斷引入非洲的兩個(gè)主要地區(qū)——西非和中東/南部非洲。

《張文非洲研究》的第一作者弗朗索瓦·澤維爾·威爾說(shuō):“我們的研究結(jié)果表明，自20世紀(jì)70年代以來(lái)，各種各樣的7PET細(xì)菌的新版本已經(jīng)進(jìn)入非洲。一旦引入，霍亂疫情沿著類似的路徑在非洲大陸蔓延。這一結(jié)果使我們想到，我們可以加強(qiáng)對(duì)非洲這些特定地區(qū)的監(jiān)測(cè)和控制。”

科學(xué)家們還研究了霍亂抗生素耐藥性的演變。研究小組發(fā)現(xiàn)，最近進(jìn)入非洲的霍亂細(xì)菌對(duì)抗生素產(chǎn)生了耐藥性。利用基因組數(shù)據(jù)，他們可以追蹤南亞抗生素耐藥性的來(lái)源。

3在拉丁美洲

在拉丁美洲的研究文章中，研究小組不僅關(guān)注7PET菌株引起的傳染病，還關(guān)注其他霍亂弧菌菌株引起的散發(fā)性低水平疾病。他們發(fā)現(xiàn)不同的霍亂弧菌菌株會(huì)有不同的風(fēng)險(xiǎn)，導(dǎo)致大規(guī)模爆發(fā)。這對(duì)世界霍亂控制有很大影響。

《美洲霍亂弧菌綜合觀》的第一作者達(dá)里爾·多曼(Daryl Domman)說(shuō):“我們的數(shù)據(jù)顯示，當(dāng)一種7PET流行毒株從其他地方進(jìn)入拉丁美洲時(shí)，它可以引起大規(guī)模的疫情，就像1990年的秘魯和2010年的海地一樣。但是，我們現(xiàn)在知道，這個(gè)地區(qū)已經(jīng)存在的其他毒株仍然可以使人生病，但似乎沒(méi)有發(fā)生這種流行病的可能性。了解哪種細(xì)菌引起的可以使地區(qū)或國(guó)家政府做出適當(dāng)?shù)墓残l(wèi)生反應(yīng)。”

4意義和應(yīng)用價(jià)值

文章的通訊作者、來(lái)自韋爾科姆信托桑格研究所和倫敦大學(xué)的尼克·湯姆森教授說(shuō):“這些發(fā)現(xiàn)將對(duì)控制霍亂疫情產(chǎn)生影響。現(xiàn)在我們真的知道霍亂是如何在全世界傳播的了。通過(guò)掌握這些信息，我們可以了解基本的科學(xué)知識(shí)和改進(jìn)的控制策略，以便更好地了解一種對(duì)人類健康構(gòu)成如此威脅的簡(jiǎn)單細(xì)菌。”