孫家(1898年7月~ 1900年春季)

許景成(1899年7月~ 1900年7月)

張伯熙(1902年1月至1904年2月)

張衡家(1904年2月-1906年2月)

李家(1906年2月至1907年7月)

周翼藩(1907年7月至1907年12月)

劉正亨(1907年12月至1910年9月)

嚴(yán)復(fù)(1912年2月至1912年10月)

霍希市(1912年12月-1913年11月)

霍人(1913年11月至1916年12月)

蔡元培(1916年12月至1927年8月)

劉哲(1927年8月至1928年6月)

李大英(1928年6月至1929年1月)

晉代帝(1929年1月至1929年8月)

蔡元培(1929年9月至1930年12月)

張夢(mèng)麟(1930年12月-1945年)

胡適(1945-1948年)

湯龍彤(1949年5月-1951年9月)

馬寅初(1951年6月至1960年3月)

陸平(1960年3月至1966年6月)

張勝善(1966年6月1日至1966年7月26日)

周培源(1978年7月至1981年3月)

張龍祥(1981年5月至1984年3月)

鄭錫孫(1984年3月至1989年8月)

吳秀清(1989年8月至1996年8月)

陳嘉爾(1996年7月至1999年11月)

許志紅(1999年11月至2008年11月)

周其峰(2008年11月至2013年3月)

王恩哥(2013年3月~ 2015年2月)

林建華(2015.02-2018.10年)

郝平(2018.10年至今)